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DNA微阵列(基因芯片)简介

(DNA Microarrays)技术/基因芯片(Genechip)技术是一种在上世纪80年代开始研制,90年代成熟和推广并得到广泛应用的生物学检测技术。目前英文中大多使用DNA微阵列(DNA Microarrays)来表示基因芯片,而Genechip已经被美国申请商用专利。

DNA微阵列(基因芯片)技术的出现是生物学相关领域的一个里程碑事件。它使得生物学、医学等领域研究快速发展,与之相关的科学论文数以万记(未统计具体数字,表示很多的意思)。而且,这项产生于上个世纪的基因芯片技术目前仍然是生物科学领域最具应用价值的技术之一(80年代-克隆,90年代-PCR,21世纪-芯片)。

DNA微阵列(基因芯片)技术和传统的、等技术一样,均基于核酸之间的互补结合特性开发,但是传统技术只能针对单个基因来分析,而微阵列技术则开启了高通量模式。

如果是第一次接触这个概念,你可以先简单的把微阵列理解成是一种和计算机芯片(如)在体积上类似(都很小),并主要用于定性或定量测定生命体内物质的检测技术。区别在于微阵列(如DNA Microarrays)并不能用来进行加减乘除等数学运算,而CPU可以)。

所涉及的名词和技术

如果你有知识体系构建的习惯,可以将这次所要学习的内容大致与以下名词做一些关联:

  • 生物学
  • 生物学过程
  • 基因及其产物
  • 标记、杂交以及显微成像技术
  • 定性和定量检测技术
  • 计算机自动处理技术
  • ......

相关知识所依赖的场所:

  • 生物体内(in vivo)
  • 生物体外(in vitro)
  • 计算机内(in silico)

学习它的重要性

如果你参加过与生物信息学相关的培训或者导读课程,就会知道,DNA微阵列(基因芯片)技术常常是作为这些课程的必修内容之一。

  • 通过学习DNA微阵列(基因芯片)技术的相关概念、基本原理、数据分析方法及其注意事项,将是你入门的最好的一次机会。
  • 了解芯片技术有助于大家进一步学习生物信息学涉及到的其他新型技术,比如全外显子测序和靶向测序、全基因组测序、全转录组测序、单细胞测序等。
  • 在学习相关的数据分析过程中,你将会积累一部分编程经验(如R和Bash),这对于以后熟练掌握编程技术也非常有意义。而编程技术的掌握与否则是衡量一个人生物信息学入门的最基本的指标之一。
  • 掌握它之后,你可以利用公共芯片数据进行数据挖掘,用于验证你de想法或者发现新的知识。你现在可以搜索一下中和微阵列(基因芯片)相关的数据,试着回答一下上面的数据都有哪些类型?

两个“简单”问题

  • 生物和非生物体的主要区别在哪里?
  • 生物体内的遗传信息传递依赖哪些物质?它的流动顺序是怎样的?

我建议在这里你可以稍微发动一下你的想象力,尽量基于你已有的知识或者凭空猜一猜看。

如果你已经有自己的答案或者实在想不出来则可以继续往下(这样会加深你对这两个问题的印象)。

生物和非生物体的主要区别在哪里?

生物的九大基本特征:

  1. 生物体具有严整的结构(细胞是生物体结构和功能的基本单位)。
  2. 生物体能进行新陈代谢。
  3. 生物体能生长。
  4. 生物体具有应激性。
  5. 生物体能生殖和发育。
  6. 生物体具有遗传和变异的特性。
  7. 生物体能在一定程度上适应环境并影响环境。
  8. 生物体能跟外界进行物质交换。
  9. 生物体可以呼吸。

自主阅读,并回答:

  • 生物、细胞、遗传物质以及代谢产物之间的关系?
  • 生物主要分为几大类?人属于哪一类?
  • 真核生物和原核生物的区别有哪些?它们的遗传物质的种类是否相同?
  • 病毒属不属于生物?它有没有遗传物质?如果它不属于生物,原因是什么?
  • 微生物能不能呼吸?它的呼吸方式有哪些?

生物体内的遗传信息传递依赖哪些物质?它的流动顺序是怎样的?

这里要引入一个非常重要的概念::生物体内的遗传信息沿着DNA-RNA-蛋白质轴流动,DNA->DNA:DNA复制,DNA->RNA:转录,RNA->RNA

DNA微阵列(基因芯片)简介

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